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变性、吸附、聚集或沉淀：变性一般都是与三维结构以及二级结构的破坏有关。

在变性状态多肽往往更易发生化学反应，活性难以恢复。


在多肽变性过程中，首先形成中间体。通常中间体的溶解度低，易于聚集，形成聚集体，进而形成肉眼可见的沉淀。


蛋白质的表面吸附是其储存、使用过程中遇到的另一个问题，如在进行灌注时会吸附在管道表面，造成活性损失。